Variante do coronavírus: por que o Japão descobriu antes do Brasil a linhagem do vírus vindabwin live rouletteManaus:bwin live roulette

O virologista Felipe Naveca, pesquisador do Instituto Leônidas & Maria Deane (ILMD/Fiocruz Amazônia), referência na análise genômica no Amazonas, onde foi identificada a variante que tem preocupado especialistas, afirma que não existe uma rotina diáriabwin live roulettesequenciamento genético na região.

"Para fazer isso teríamos que ter uma equipe dedicada só ao sequenciamento, com automação e investimentos muito maiores do que há hoje", diz ele.

"Caso contrário, todo o recurso acabariabwin live roulette3 meses, quando a nossa proposta é sequenciar durante o maior tempo possível e mostrar as mudanças ao longo desse tempo."

Em paralelo ao processamentobwin live roulettediagnósticosbwin live roulettetestesbwin live roulettePCR, também feito no instituto, a equipe sequencia 96 genomasbwin live roulettealta qualidade a cada duas ou três semanas.

A África do Sul, que tem cercabwin live rouletteum quarto da população brasileira e tem sido considerado um exemplo bem sucedidobwin live roulettevigilância, sequencia entre 50 e 100 genomasbwin live roulettecoronavírus por semana.

O Reino Unido faz cercabwin live roulette10 mil sequenciamentos por semana e se prepara para dobrar esse número nos próximos meses. O país tembwin live roulettelonge a maior capacidadebwin live rouletteprocessamento, respondendo por cercabwin live roulette200 mil entre os 400 mil genomas compartilhados por cientistasbwin live roulettetodo o mundo na plataforma Gisaid.

Concorrência entre sequenciamento e examesbwin live roulettePCR

Não existem dados consolidados sobre o volume sequenciado por semana no país ou a capacidadebwin live rouletteprocessamento.

Existem algumas iniciativas que caminhambwin live rouletteparalelo — uma delas é a rede genômica da Fiocruz, que conta com instituiçõesbwin live roulette11 Estados e analisa amostrasbwin live roulettetodo o país.

A chefe do Laboratóriobwin live rouletteVírus Respiratórios e Sarampo do Instituto Oswaldo Cruz (IOC/Fiocruz), Marilda Siqueira, que atua como Centrobwin live rouletteReferência Nacionalbwin live roulettevírus respiratórios junto ao Ministério da Saúde, afirma que os laboratórios da rede têm realizado sequenciamentos desde o início da pandemia — uma expertise que vembwin live rouletteparte da vigilância genômica do vírus influenza feita há anos pelo grupo.

Dada a gravidade da pandemia no país, entretanto, o trabalho tem muitas vezesbwin live rouletteser dividido com o processamentobwin live rouletteexames diagnósticosbwin live roulettePCR - por isso o volumebwin live rouletteanálises genômicas é inferior ao que as equipes desejariam.

Ainda assim, ressalta Marilda, o Brasil responde por cercabwin live roulette2,4 mil dos 5 mil genomas do Sars-CoV-2 cadastrados pela América do Sul na plataforma Gisaid.

"A gente não está tão ruim assim quando se pensabwin live rouletteregião. Temos, claro, que melhorar, e estamos buscando essa melhora."

O esforço agora, diz ela, é para que a vigilância genômica do coronavírus sejabwin live roulettetempo real, para que o país conheça as variantes que circulam no territóriobwin live rouletteforma mais rápida e os gestoresbwin live roulettesaúde possam "se antecipar" para tentar controlar, por exemplo, a disseminaçãobwin live roulettelinhagens que sejam mais transmissíveis.

Para isso, é preciso aumentar o númerobwin live rouletteamostras sequenciadas e estruturar uma logística que garanta a análise sistemáticabwin live roulettedadosbwin live roulettetoda as regiões do país.

A linhagem descobertabwin live rouletteManaus, que tem preocupado cientistasbwin live roulettetodo o mundo, tornou esse avanço ainda mais premente, mas o esforço para tentar ampliar a análise genômica das amostras do país é anterior, diz a pesquisadora.

Reagentes cotadosbwin live roulettedólar

Em outra frente, o Brasil conta com a ajudabwin live rouletteum dos 300 supercomputadores mais potentes do mundo — o SDumont, que fica no Laboratório Nacionalbwin live rouletteComputação Científica (LNCC),bwin live roulettePetrópolis (RJ).

Lá, a pesquisadora Ana Tereza Ribeirobwin live rouletteVasconcelos, responsável pelo Laboratóriobwin live rouletteBioinformática do LNCC, ebwin live rouletteequipebwin live roulette25 pesquisadores fazem o sequenciamentobwin live rouletteamostras do Riobwin live rouletteJaneiro ebwin live rouletteoutras regiões do país.

Do início da pandemia até o momento, foram feitos cercabwin live roulette400 sequenciamentos, um número bem abaixo do que a cientista gostaria.

O principal gargalo, diz ela, é verba.

"Estrutura física o Brasil tem, pessoal qualificado, também — trabalhamosbwin live rouletterede genômica há 20, 30 anos", afirma. "A gente precisabwin live roulettemais recursos para custeio, para comprar reagentes e ter acesso às amostras das diferentes regiões do país."

Os reagentes usados no processobwin live roulettesequenciamento são importados — e passaram a custar bem mais com a desvalorização do real nos últimos meses.

Antes disso, entretanto, a vigilância genômica já havia sido impactada pelos cortes sucessivos que o orçamento da Ciência e Tecnologia vem sofrendo no país pelo menos desde 2016.

"E vigilância genômica é algo que tembwin live rouletteser constante, a ideia é antever o que vai acontecer", pontua Ana Tereza.

A burocracia brasileira para aprovação e liberaçãobwin live rouletterecursos

O virologista Fernando Spilki, professor da Feevale, diz que o Brasil tem condiçõesbwin live roulette"recuperar o terreno perdido" nessa área daqui para frente, com a liberaçãobwin live rouletterecursos para pesquisas relacionadas à covid-19.

Ele está à frente da rede Corona-ômica BR MCTIC/Finep, um grande projetobwin live roulettesequenciamento do Sars-CoV-2 que começou a ser desenhadobwin live roulettefevereiro do ano passado e recebeu a primeira parte do financiamento — que vai chegar no total a cercabwin live rouletteR$ 10 milhões — entre setembro e outubro.

A demora para liberaçãobwin live rouletterecursos, segundo ele, não é exclusividade do momento atual, mas "a rotina do pesquisador brasileiro".

A rede conta no momento com 14 instituições associadas, com 30 bolsistas CNPQ e mais uma centenabwin live roulettepesquisadores. Um dos objetivos é mapear as linhagens do coronavírus que estão circulandobwin live roulettealgumas regiões do país e entender o significado práticobwin live roulettealgumas mutações.

Comentando sobre o esforço dos cientistas do país na áreabwin live roulettevigilância genômica do coronavírus, o virologista acrescenta que a nova variante que circulabwin live rouletteManaus foi detectada primeiro no Japão e não no Brasil "por uma questãobwin live roulettehoras".

Ele se refere ao trabalho dos cientistas do Centro Brasil-Reino Unidobwin live rouletteDescoberta, Diagnóstico, Genômica e Epidemiologiabwin live rouletteArbovírus (grupo Cadde), que publicaram dois dias depois da notificação das autoridades japonesas um estudo preliminarbwin live rouletteque detalhavam a variante.

O grupo, que também tem se dedicado a acompanhar por meio da análise genética a evolução do coronavírus, é coordenado pela imunologista Ester Sabino, pesquisadora do Institutobwin live rouletteMedicina Tropical da Faculdadebwin live rouletteMedicina da USP, que também esteve à frente do primeiro sequenciamento do genoma do Sars-CoV-2 realizado no país,bwin live roulettefevereirobwin live roulette2020.

Já o Japão não está entre os 10 países que mais têm feito sequenciamento do genoma do vírusbwin live rouletteproporção ao totalbwin live rouletteinfectados, mas tem realizado uma políticabwin live roulettevigilância epidemiológica ativabwin live rouletteseus aeroportos na tentativabwin live rouletteevitar um aumento explosivo no númerobwin live roulettecasos da doença.

A grande maioria dos aeroportos conta há meses com "estaçõesbwin live roulettequarentena", para onde são enviados os viajantes com diagnóstico positivo para covid.

O país realiza testesbwin live roulettemassa nos turistas e residentes que chegam do exterior — daí a razão por que identificou com rapidez a variante que circula no Amazonas.

O Brasil, porbwin live roulettevez, não faz vigilância epidemiológica ativa nos aeroportos. As medidas estão mais rígidas desde o dia 31bwin live roulettedezembro, quando o país passou a exigir dos passageirosbwin live roulettevoos internacionais um comprovantebwin live roulettediagnóstico negativo da doençabwin live rouletteaté 72 horas antes do embarque.

Antes disso, contudo, havia protocolos para casos suspeitos, mas, como se sabe, uma grande quantidadebwin live roulettecasosbwin live roulettecovid-19 é assintomática.

O 'padrão ouro' do Reino Unido

O Reino Unido realiza hoje o maior número diáriobwin live roulettesequenciamentos do genoma do coronavírus e tem uma estrutura única, que conta com o trabalho diretobwin live roulettecercabwin live roulette400 pessoas.

O diretorbwin live rouletteestratégia da força-tarefa, batizadabwin live rouletteCovid-19 Genomics UK Consortium (COG-UK), Ewan Harrison, conta que a equipe vai muito além dos cientistas e envolve uma grande operação logística,bwin live rouletteque caminhões transportam diariamente amostras do vírus coletadasbwin live roulettetodo o país para os 16 hubsbwin live roulettesequenciamento.

A história começoubwin live roulette4bwin live roulettemarço, diante da preocupação entre especialistasbwin live roulettegenomasbwin live roulettepatógenos com a rápida expansão da covid-19 no país.

Menosbwin live rouletteduas semanas depois, após dias seguidosbwin live roulettereuniões, o grupo formalizou uma proposta e a apresentou ao governo e a organismosbwin live roulettefomento.

Naquele momento, alguns críticos ao projeto argumentavam que os coronavírus mutavam menos do que muitos outros, como o influenza e o HIV, e que o esforço, portanto, seria uma perdabwin live roulettetempo.

Parte deles não imaginava, entretanto, que o vírus infectaria milhõesbwin live roulettepessoas, o que acabou abrindo portas para a ocorrênciabwin live rouletteuma sériebwin live roulettemutações.

"Quando o vírus se replica, quando faz uma cópiabwin live roulettesi mesmo (de seu material genético), ele ocasionalmente comete erros", explica o microbiologista Ewan Harrison, ligado à Universidadebwin live rouletteCambridge e ao Covid-19 Genomics UK Consortium.

"Quanto mais vírus circulando, maior a probabilidadebwin live rouletteisso acontecer. Quanto mais longas as infecções, maiores as chancesbwin live rouletteo vírus desenvolver uma mutação."

Naquele momento, o consórcio obteve um financiamentobwin live roulette20 milhõesbwin live roulettelibras (cercabwin live rouletteR$ 147 milhões) e acaboubwin live roulettever aprovado um aporte adicionalbwin live roulette12 milhões (R$ 88 milhões), que será usadobwin live rouletteparte para expandir a capacidadebwin live roulettesequenciamentos por semana para 20 mil e, posteriormente, para 30 mil.

"Nós nunca fizemos o sequenciamento genéticobwin live rouletteum patógeno nessa escala,bwin live roulettetão curto períodobwin live roulettetempo. O que temos visto é a evoluçãobwin live rouletteação", acrescenta Harrison.

"Isso só reforça o fatobwin live rouletteque precisamos manter o númerobwin live roulettecasos sob controle, temos que manter as medidas para tentar conter o vírus — usar máscaras, manter o distanciamento social, a higiene das mãos", completa.

No caso da variante identificada no país, o cientista conta que o consórcio foi notificado no iníciobwin live roulettedezembro sobre um aumento súbitobwin live roulettecasosbwin live rouletteLondres e no sudeste do Reino Unido. A partir daí, os pesquisadores foram buscar no bancobwin live roulettegenomas amostras daquela região para entender se havia algo diferente.

Foi aí que descobriram a B117, que tem 24 mutações, 13 que afetam a espícula, que está associada à entrada do vírus na célula do hospedeiro. Há indicativosbwin live rouletteque as mutações tenham tornado essa cepa mais contagiosa, mas não há indíciosbwin live rouletteque ela leve a quadros mais gravesbwin live roulettecovid-19.

A variantebwin live rouletteManaus

A virologista italiana Marta Giovanetti, que desde 2016 realiza pesquisas no Brasil e tem se dedicado à vigilância genômica do Sars-CoV-2 aqui, ressalta que o modelo britânico é um ponto fora da curva.

Para ela, a resposta do Brasil foi mais interessante do que abwin live rouletteseu país, que só mais recentemente passou a sequenciar mais genomas e a "produzir mais conhecimento".

"A gente viu que as regiões mais afetadas (na Itália) geraram genomas na ordembwin live roulettecentenas. Isso não descreve a realidade do que aconteceu, não permite realizar algum tipobwin live rouletteinferência", afirma.

"Isso foi um pouco diferente no Brasil — lógico que poderia ser bem melhor", completa.

Assim como a variante identificada no Reino Unido e na África do Sul, a encontradabwin live rouletteManaus apresentou mutações nos genes que codificam a espícula, a proteína que permite a entrada do vírus nas células humanas — e que pode indicar um aumento na transmissibilidade do vírus.

Os dados analisados indicam que ela surgiu entre novembro e dezembro, diz Naveca, do Instituto Leônidas & Maria Deane (ILMD/Fiocruz Amazônia). O pesquisador espera aumentar o númerobwin live roulettesequenciamentos para identificar se a nova linhagem está circulandobwin live roulettetodo Estado e,bwin live roulettecaso positivo, com qual frequência. Por enquanto, não há dados sobre a circulação da variante no restante do país.

Para Naveca, por mais que a evolução do vírus seja esperada, a nova cepa encontrada no Reino Unido, na África do Sul e, agora, no Brasil chamam atenção.

"Elas acumularam muitas mutaçõesbwin live roulettepouco tempo, acima do que a gente estava vendo até o momento."

Ainda assim, as razões por trás da explosão no númerobwin live roulettecasos no Amazonas ainda precisam ser melhor estudadas, diz o pesquisador, já que a explicação pode ser multifatorial.

Além da variante que pode ser mais contagiosa, a região entroubwin live roulettenovembro na temporadabwin live roulettevírus respiratórios, com o "inverno amazônico", e ainda reduziu o distanciamento social no períodobwin live roulettefestas.

Por isso, o cientista faz um apelo aos brasileiros para que sigam as recomendações para tentar evitar a disseminação do vírus no país.

"O vírus mutante não atravessa a máscara, não resiste à lavagem das mãos com água e sabão, ao usobwin live rouletteálcool gel. A transmissão também é evitada com o distanciamento social."

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