Variante do coronavírus: por que o Japão descobriu antes do Brasil a linhagem do vírus vindabrasileirao serie a 2024Manaus:brasileirao serie a 2024

O virologista Felipe Naveca, pesquisador do Instituto Leônidas & Maria Deane (ILMD/Fiocruz Amazônia), referência na análise genômica no Amazonas, onde foi identificada a variante que tem preocupado especialistas, afirma que não existe uma rotina diáriabrasileirao serie a 2024sequenciamento genético na região.

"Para fazer isso teríamos que ter uma equipe dedicada só ao sequenciamento, com automação e investimentos muito maiores do que há hoje", diz ele.

"Caso contrário, todo o recurso acabariabrasileirao serie a 20243 meses, quando a nossa proposta é sequenciar durante o maior tempo possível e mostrar as mudanças ao longo desse tempo."

Em paralelo ao processamentobrasileirao serie a 2024diagnósticosbrasileirao serie a 2024testesbrasileirao serie a 2024PCR, também feito no instituto, a equipe sequencia 96 genomasbrasileirao serie a 2024alta qualidade a cada duas ou três semanas.

A África do Sul, que tem cercabrasileirao serie a 2024um quarto da população brasileira e tem sido considerado um exemplo bem sucedidobrasileirao serie a 2024vigilância, sequencia entre 50 e 100 genomasbrasileirao serie a 2024coronavírus por semana.

O Reino Unido faz cercabrasileirao serie a 202410 mil sequenciamentos por semana e se prepara para dobrar esse número nos próximos meses. O país tembrasileirao serie a 2024longe a maior capacidadebrasileirao serie a 2024processamento, respondendo por cercabrasileirao serie a 2024200 mil entre os 400 mil genomas compartilhados por cientistasbrasileirao serie a 2024todo o mundo na plataforma Gisaid.

Concorrência entre sequenciamento e examesbrasileirao serie a 2024PCR

Não existem dados consolidados sobre o volume sequenciado por semana no país ou a capacidadebrasileirao serie a 2024processamento.

Existem algumas iniciativas que caminhambrasileirao serie a 2024paralelo — uma delas é a rede genômica da Fiocruz, que conta com instituiçõesbrasileirao serie a 202411 Estados e analisa amostrasbrasileirao serie a 2024todo o país.

A chefe do Laboratóriobrasileirao serie a 2024Vírus Respiratórios e Sarampo do Instituto Oswaldo Cruz (IOC/Fiocruz), Marilda Siqueira, que atua como Centrobrasileirao serie a 2024Referência Nacionalbrasileirao serie a 2024vírus respiratórios junto ao Ministério da Saúde, afirma que os laboratórios da rede têm realizado sequenciamentos desde o início da pandemia — uma expertise que vembrasileirao serie a 2024parte da vigilância genômica do vírus influenza feita há anos pelo grupo.

Dada a gravidade da pandemia no país, entretanto, o trabalho tem muitas vezesbrasileirao serie a 2024ser dividido com o processamentobrasileirao serie a 2024exames diagnósticosbrasileirao serie a 2024PCR - por isso o volumebrasileirao serie a 2024análises genômicas é inferior ao que as equipes desejariam.

Ainda assim, ressalta Marilda, o Brasil responde por cercabrasileirao serie a 20242,4 mil dos 5 mil genomas do Sars-CoV-2 cadastrados pela América do Sul na plataforma Gisaid.

"A gente não está tão ruim assim quando se pensabrasileirao serie a 2024região. Temos, claro, que melhorar, e estamos buscando essa melhora."

O esforço agora, diz ela, é para que a vigilância genômica do coronavírus sejabrasileirao serie a 2024tempo real, para que o país conheça as variantes que circulam no territóriobrasileirao serie a 2024forma mais rápida e os gestoresbrasileirao serie a 2024saúde possam "se antecipar" para tentar controlar, por exemplo, a disseminaçãobrasileirao serie a 2024linhagens que sejam mais transmissíveis.

Para isso, é preciso aumentar o númerobrasileirao serie a 2024amostras sequenciadas e estruturar uma logística que garanta a análise sistemáticabrasileirao serie a 2024dadosbrasileirao serie a 2024toda as regiões do país.

A linhagem descobertabrasileirao serie a 2024Manaus, que tem preocupado cientistasbrasileirao serie a 2024todo o mundo, tornou esse avanço ainda mais premente, mas o esforço para tentar ampliar a análise genômica das amostras do país é anterior, diz a pesquisadora.

Reagentes cotadosbrasileirao serie a 2024dólar

Em outra frente, o Brasil conta com a ajudabrasileirao serie a 2024um dos 300 supercomputadores mais potentes do mundo — o SDumont, que fica no Laboratório Nacionalbrasileirao serie a 2024Computação Científica (LNCC),brasileirao serie a 2024Petrópolis (RJ).

Lá, a pesquisadora Ana Tereza Ribeirobrasileirao serie a 2024Vasconcelos, responsável pelo Laboratóriobrasileirao serie a 2024Bioinformática do LNCC, ebrasileirao serie a 2024equipebrasileirao serie a 202425 pesquisadores fazem o sequenciamentobrasileirao serie a 2024amostras do Riobrasileirao serie a 2024Janeiro ebrasileirao serie a 2024outras regiões do país.

Do início da pandemia até o momento, foram feitos cercabrasileirao serie a 2024400 sequenciamentos, um número bem abaixo do que a cientista gostaria.

O principal gargalo, diz ela, é verba.

"Estrutura física o Brasil tem, pessoal qualificado, também — trabalhamosbrasileirao serie a 2024rede genômica há 20, 30 anos", afirma. "A gente precisabrasileirao serie a 2024mais recursos para custeio, para comprar reagentes e ter acesso às amostras das diferentes regiões do país."

Os reagentes usados no processobrasileirao serie a 2024sequenciamento são importados — e passaram a custar bem mais com a desvalorização do real nos últimos meses.

Antes disso, entretanto, a vigilância genômica já havia sido impactada pelos cortes sucessivos que o orçamento da Ciência e Tecnologia vem sofrendo no país pelo menos desde 2016.

"E vigilância genômica é algo que tembrasileirao serie a 2024ser constante, a ideia é antever o que vai acontecer", pontua Ana Tereza.

A burocracia brasileira para aprovação e liberaçãobrasileirao serie a 2024recursos

O virologista Fernando Spilki, professor da Feevale, diz que o Brasil tem condiçõesbrasileirao serie a 2024"recuperar o terreno perdido" nessa área daqui para frente, com a liberaçãobrasileirao serie a 2024recursos para pesquisas relacionadas à covid-19.

Ele está à frente da rede Corona-ômica BR MCTIC/Finep, um grande projetobrasileirao serie a 2024sequenciamento do Sars-CoV-2 que começou a ser desenhadobrasileirao serie a 2024fevereiro do ano passado e recebeu a primeira parte do financiamento — que vai chegar no total a cercabrasileirao serie a 2024R$ 10 milhões — entre setembro e outubro.

A demora para liberaçãobrasileirao serie a 2024recursos, segundo ele, não é exclusividade do momento atual, mas "a rotina do pesquisador brasileiro".

A rede conta no momento com 14 instituições associadas, com 30 bolsistas CNPQ e mais uma centenabrasileirao serie a 2024pesquisadores. Um dos objetivos é mapear as linhagens do coronavírus que estão circulandobrasileirao serie a 2024algumas regiões do país e entender o significado práticobrasileirao serie a 2024algumas mutações.

Comentando sobre o esforço dos cientistas do país na áreabrasileirao serie a 2024vigilância genômica do coronavírus, o virologista acrescenta que a nova variante que circulabrasileirao serie a 2024Manaus foi detectada primeiro no Japão e não no Brasil "por uma questãobrasileirao serie a 2024horas".

Ele se refere ao trabalho dos cientistas do Centro Brasil-Reino Unidobrasileirao serie a 2024Descoberta, Diagnóstico, Genômica e Epidemiologiabrasileirao serie a 2024Arbovírus (grupo Cadde), que publicaram dois dias depois da notificação das autoridades japonesas um estudo preliminarbrasileirao serie a 2024que detalhavam a variante.

O grupo, que também tem se dedicado a acompanhar por meio da análise genética a evolução do coronavírus, é coordenado pela imunologista Ester Sabino, pesquisadora do Institutobrasileirao serie a 2024Medicina Tropical da Faculdadebrasileirao serie a 2024Medicina da USP, que também esteve à frente do primeiro sequenciamento do genoma do Sars-CoV-2 realizado no país,brasileirao serie a 2024fevereirobrasileirao serie a 20242020.

Já o Japão não está entre os 10 países que mais têm feito sequenciamento do genoma do vírusbrasileirao serie a 2024proporção ao totalbrasileirao serie a 2024infectados, mas tem realizado uma políticabrasileirao serie a 2024vigilância epidemiológica ativabrasileirao serie a 2024seus aeroportos na tentativabrasileirao serie a 2024evitar um aumento explosivo no númerobrasileirao serie a 2024casos da doença.

A grande maioria dos aeroportos conta há meses com "estaçõesbrasileirao serie a 2024quarentena", para onde são enviados os viajantes com diagnóstico positivo para covid.

O país realiza testesbrasileirao serie a 2024massa nos turistas e residentes que chegam do exterior — daí a razão por que identificou com rapidez a variante que circula no Amazonas.

O Brasil, porbrasileirao serie a 2024vez, não faz vigilância epidemiológica ativa nos aeroportos. As medidas estão mais rígidas desde o dia 31brasileirao serie a 2024dezembro, quando o país passou a exigir dos passageirosbrasileirao serie a 2024voos internacionais um comprovantebrasileirao serie a 2024diagnóstico negativo da doençabrasileirao serie a 2024até 72 horas antes do embarque.

Antes disso, contudo, havia protocolos para casos suspeitos, mas, como se sabe, uma grande quantidadebrasileirao serie a 2024casosbrasileirao serie a 2024covid-19 é assintomática.

O 'padrão ouro' do Reino Unido

O Reino Unido realiza hoje o maior número diáriobrasileirao serie a 2024sequenciamentos do genoma do coronavírus e tem uma estrutura única, que conta com o trabalho diretobrasileirao serie a 2024cercabrasileirao serie a 2024400 pessoas.

O diretorbrasileirao serie a 2024estratégia da força-tarefa, batizadabrasileirao serie a 2024Covid-19 Genomics UK Consortium (COG-UK), Ewan Harrison, conta que a equipe vai muito além dos cientistas e envolve uma grande operação logística,brasileirao serie a 2024que caminhões transportam diariamente amostras do vírus coletadasbrasileirao serie a 2024todo o país para os 16 hubsbrasileirao serie a 2024sequenciamento.

A história começoubrasileirao serie a 20244brasileirao serie a 2024março, diante da preocupação entre especialistasbrasileirao serie a 2024genomasbrasileirao serie a 2024patógenos com a rápida expansão da covid-19 no país.

Menosbrasileirao serie a 2024duas semanas depois, após dias seguidosbrasileirao serie a 2024reuniões, o grupo formalizou uma proposta e a apresentou ao governo e a organismosbrasileirao serie a 2024fomento.

Naquele momento, alguns críticos ao projeto argumentavam que os coronavírus mutavam menos do que muitos outros, como o influenza e o HIV, e que o esforço, portanto, seria uma perdabrasileirao serie a 2024tempo.

Parte deles não imaginava, entretanto, que o vírus infectaria milhõesbrasileirao serie a 2024pessoas, o que acabou abrindo portas para a ocorrênciabrasileirao serie a 2024uma sériebrasileirao serie a 2024mutações.

"Quando o vírus se replica, quando faz uma cópiabrasileirao serie a 2024si mesmo (de seu material genético), ele ocasionalmente comete erros", explica o microbiologista Ewan Harrison, ligado à Universidadebrasileirao serie a 2024Cambridge e ao Covid-19 Genomics UK Consortium.

"Quanto mais vírus circulando, maior a probabilidadebrasileirao serie a 2024isso acontecer. Quanto mais longas as infecções, maiores as chancesbrasileirao serie a 2024o vírus desenvolver uma mutação."

Naquele momento, o consórcio obteve um financiamentobrasileirao serie a 202420 milhõesbrasileirao serie a 2024libras (cercabrasileirao serie a 2024R$ 147 milhões) e acaboubrasileirao serie a 2024ver aprovado um aporte adicionalbrasileirao serie a 202412 milhões (R$ 88 milhões), que será usadobrasileirao serie a 2024parte para expandir a capacidadebrasileirao serie a 2024sequenciamentos por semana para 20 mil e, posteriormente, para 30 mil.

"Nós nunca fizemos o sequenciamento genéticobrasileirao serie a 2024um patógeno nessa escala,brasileirao serie a 2024tão curto períodobrasileirao serie a 2024tempo. O que temos visto é a evoluçãobrasileirao serie a 2024ação", acrescenta Harrison.

"Isso só reforça o fatobrasileirao serie a 2024que precisamos manter o númerobrasileirao serie a 2024casos sob controle, temos que manter as medidas para tentar conter o vírus — usar máscaras, manter o distanciamento social, a higiene das mãos", completa.

No caso da variante identificada no país, o cientista conta que o consórcio foi notificado no iníciobrasileirao serie a 2024dezembro sobre um aumento súbitobrasileirao serie a 2024casosbrasileirao serie a 2024Londres e no sudeste do Reino Unido. A partir daí, os pesquisadores foram buscar no bancobrasileirao serie a 2024genomas amostras daquela região para entender se havia algo diferente.

Foi aí que descobriram a B117, que tem 24 mutações, 13 que afetam a espícula, que está associada à entrada do vírus na célula do hospedeiro. Há indicativosbrasileirao serie a 2024que as mutações tenham tornado essa cepa mais contagiosa, mas não há indíciosbrasileirao serie a 2024que ela leve a quadros mais gravesbrasileirao serie a 2024covid-19.

A variantebrasileirao serie a 2024Manaus

A virologista italiana Marta Giovanetti, que desde 2016 realiza pesquisas no Brasil e tem se dedicado à vigilância genômica do Sars-CoV-2 aqui, ressalta que o modelo britânico é um ponto fora da curva.

Para ela, a resposta do Brasil foi mais interessante do que abrasileirao serie a 2024seu país, que só mais recentemente passou a sequenciar mais genomas e a "produzir mais conhecimento".

"A gente viu que as regiões mais afetadas (na Itália) geraram genomas na ordembrasileirao serie a 2024centenas. Isso não descreve a realidade do que aconteceu, não permite realizar algum tipobrasileirao serie a 2024inferência", afirma.

"Isso foi um pouco diferente no Brasil — lógico que poderia ser bem melhor", completa.

Assim como a variante identificada no Reino Unido e na África do Sul, a encontradabrasileirao serie a 2024Manaus apresentou mutações nos genes que codificam a espícula, a proteína que permite a entrada do vírus nas células humanas — e que pode indicar um aumento na transmissibilidade do vírus.

Os dados analisados indicam que ela surgiu entre novembro e dezembro, diz Naveca, do Instituto Leônidas & Maria Deane (ILMD/Fiocruz Amazônia). O pesquisador espera aumentar o númerobrasileirao serie a 2024sequenciamentos para identificar se a nova linhagem está circulandobrasileirao serie a 2024todo Estado e,brasileirao serie a 2024caso positivo, com qual frequência. Por enquanto, não há dados sobre a circulação da variante no restante do país.

Para Naveca, por mais que a evolução do vírus seja esperada, a nova cepa encontrada no Reino Unido, na África do Sul e, agora, no Brasil chamam atenção.

"Elas acumularam muitas mutaçõesbrasileirao serie a 2024pouco tempo, acima do que a gente estava vendo até o momento."

Ainda assim, as razões por trás da explosão no númerobrasileirao serie a 2024casos no Amazonas ainda precisam ser melhor estudadas, diz o pesquisador, já que a explicação pode ser multifatorial.

Além da variante que pode ser mais contagiosa, a região entroubrasileirao serie a 2024novembro na temporadabrasileirao serie a 2024vírus respiratórios, com o "inverno amazônico", e ainda reduziu o distanciamento social no períodobrasileirao serie a 2024festas.

Por isso, o cientista faz um apelo aos brasileiros para que sigam as recomendações para tentar evitar a disseminação do vírus no país.

"O vírus mutante não atravessa a máscara, não resiste à lavagem das mãos com água e sabão, ao usobrasileirao serie a 2024álcool gel. A transmissão também é evitada com o distanciamento social."

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